农工党衢州学院支部成立于2012年12月，第一届主委为雷小青；2020年12月召开换届选举大会，雷小青连任主委。2021年7月，支部举行届中调整，刘雅雯当选为主委，2025年10月进行换届选举，刘雅雯连任主委，现有农工党党员15名。近年来，农工党衢州学院支部秉持“智慧引领，携手共进”的核心理念，致力于为各类企业提供全方位、高效能的专业服务，打造“助企服务”品牌。支部党员与浙江新华新材料科技有限责任公司等4家企业共建博士工作站，为企业提供政策咨询、市场策略、人才培养等方面的支持。同时，支部党员为中小学、幼儿园送去多次教育科学讲座，联合农工党市委会共同开展2023年“环境与健康宣传周”系列活动。支部获农工党浙江省委会2023年度组织工作先进集体；2024年和2025年连续获评市级先进基层组织。